Marona je osiřelá třináctiletá dívka, která žije sama na malém ostrově. Po svých rodičích zdědila jednu zvláštní schopnost. Dokáže vidět a mluvit s přízraky zesnulých lidí. Jedním z nich je i Ash, který byl známým rodičů Marony a teď slouží jako její osobní strážce. Pro svou schopnost komunikace s mrtvými je ale Marona ostatními lidmi často zatracována. Nebrání jí to však živit se jako Chroma a s pomocí přízraků plnit žádosti o pomoc.
Phantom Brave je isometrická tahová strategie. Na rozdíl od většiny ostatních nevyužívá čtvercové pole a postavami je tak možné pohybovat ve 360 stupních. Podobně jako v Disgaea: Hour of Darkness je možné bojovníky zvedat a házet, tentokrát dokonce i mimo hrací plochu a tím je vyřadit z boje. Hráč si postavy sám vytváří a přiřazuje jim jednotlivá povolání. Může je také pomocí fúze spojit a tvořit nové. Mimo příběhových map je k dispozici také možnost nechat generovat dungeony náhodně a ty využívat k dosažení vyšších levelů a zisku lepšího vybavení.
